De organisatie van het Sintermeertencollege ziet er als volgt uit:
Directie:
dhr. JM Meens, Rector, algemene leiding
mevr. M Korsten, directeur bedrijfsvoering
mevr. IMJ Eggen-Spronck, Sectordirecteur Bovenbouw
dhr. BJHW te Braak, Sectordirecteur Onderbouw
Onderwijs:
dhr. ASMH Prakken, Afdelingsleider Tweede Fase VO
mevr. GMP Gellen, Afdelingsleider Bovenbouw HAVO
mevr. JM Dreessen- van Hout, Afdelingsleider 2-3-4 VMBO-t
dhr. EPJ Reinders, Afdelingsleider 2-3 VWO (atheneum en gymnasium)
dhr. J. Eijkenboom, Afdelingsleider 2-3 HAVO
dhr. PAM Lucassen, Coördinator Brugklassen
Afdelingen
Het Sintermeertencollege werkt in afdelingen. De afdelingsleiders sturen mentoren, docenten en het zorgteam aan.
Schematisch is het Sintermeertencollege als volgt opgebouwd:
Mentoren: 
download de mentorenlijst 2009-2010>>(pdf)
Decanaat:
mevr. CM Schouren, decaan VWO
mevr. E vd Bercken, decaan HAVO, VMBO-t